《三人行必有我妹》讲述世界级的大企业──帝野集团的社长，帝野熊五郎死后，其独子帝野将悟决意遵从其父之遗嘱继承社长之位。熊五郎为让儿子能有足以继承担当的条件，施行了为期一年的特别训练，须让全体社员承认其成果足以肩任社长一职，其后，转入熊五郎的母校私立深流院学园，并邂逅成为终身伴侣的女性并与之结婚。但将悟却 存在着同父异母的妹妹！并且，那个身分不明的妹妹打算彻底隐瞒身分，在将悟不知情的状况下与之结婚！将悟为了阻止这样的情况发生而不断地奔波追查妹妹的真实身分。